Cell | 建立进化树突状细胞与辅助性T细胞相互作用模型

肝细胞-肝细胞相互起着异常比较简单，相关联大量原子与讯号闭环，学界钻研多年，仍旧是管中窥豹。来自法国巴黎PSL分析所学校的Vassili Soumelis团队于在Cell杂志上发表题为A Quantitative Multivariate Model of Human DendriticCell-T Helper Cell Communication的短文，确立了试验与学说独创的分析方法，试验上，在蛋白质程度由此可知品了肝细胞所肠道的肝蛋白酶与应激反应；学说上，确立了讯号输入可用之时有的联系和相互起着人关系。译者以人类大脑皮层状肝细胞（Dendritic cell，原称DC）与发挥作用T肝细胞（T Helper cell，原称Th）之时有的相互起着为分析都可，分析了36例DC就其的讯号原子和17种Th肠道的肝蛋白酶，并依靠这些样本确立数学建模，演算出56种已经被试验存疑的肝细胞相互人关系，与此同时，还断定出290种可能人关系，并存疑了IL-12p70可以通过IL-1讯号闭环作用于17改进型发挥作用T肝细胞（原称Th17）。首先，译者采集了人类单核肝细胞比如说的DC（MoDCs）和外周血液CD11c+DC（bDCs）两类肝细胞，并兴奋24足足。所换用的兴奋讯号主要相关联三大类共计14种。第一种：内源讯号原子，之外类似物beta（interferon β，原称IFN-β），GM-CSF， TSLP和 PGE2；第二种：Toll由此可知介导的糖类，之外Toll4介导的低剂量脂多糖（ lipopolysaccharide，原称LPS），Toll1/2介导低剂量PAM3CSK4，Dectin1低剂量Curdlan，Toll2/Dectin1低剂量 zymosan，Toll7/8介导低剂量R848，Toll3介导低剂量 poly(I：C) 和NLRP3水肿小体活化剂铝钾；第三种：细杆菌病毒，之外高温灭活的Candida albicans （原称HKCA），李斯特杆菌（Listeria monocytogenes，原称HKLM），Staphylococcus aureus （原称HKSA）， Streptococcus pneumoniae （原称HKSP）和流感病毒（influenza virus，原称flu）。接都已，译者通过流式肝细胞术等方法，由此可知品了36种DC就其原子的传达情况，其中，29种处于肝细胞表面，7种处于肝细胞肠道上清之中。结果显示，除了一些已知的DC肝细胞叛离之外，译者还有了一些最初断定：（1）zymosan兴奋的MoDCs 传达高程度的CD54 和PVR；（2）流感病毒兴奋的MoDCs可以作用于ICOSL；（3）LPS兴奋的MoDCs 可以作用于高程度的CD30L和CD83。再都已，译者将这些兴奋过的DC与T肝细胞共培养6天，随后由此可知品Th的增生成本以及17种Th就其肝蛋白酶的传达肠道情况。有趣的是，译者将Th和DC的表现相互比较，断定，这二者之时有极为存在一一对应的人关系，也就是说，两种兴奋物对DC诱发的效果近似于，但是，这两种兴奋物所处理的DC与T肝细胞共培养之后，诱发的效果很可以截然不同。接着，译者换用分布式计算的方法，以上述试验样本确立建模。简单来说，译者综合DC可用的36种讯号原子和Th可用的17种效应原子，将两两之时有的人关系简化为“朝著作用于”和“但球队向作用于”两种，并且，还加入样本库和已发表古籍中的信息，确立了比较简单的讯号作用于的网络。例如，通过这一建模，译者断定， IL-10的但球队向作用于原子之外OX40L， 4-1BBL， IL-12， TNF-α， CD58， VISTA，Galectin-3， CD80， CD29， IL-1， ICAM-3， SLAMF3， IL-28a和CD83，而朝著作用于原子之外Jagged-2， PDL1， IL-10， CD11a， HLA-DR， ICOSL， CD100， CD30L， CD18， ICAM-2和CD86，这由此可知，获取DC不同的兴奋讯号，译者就可以推断出Th叛离肝细胞IL-10的传达肠道情况。最后，译者利用这由此可知建模，试所示断定并存疑最初肝细胞相互人关系。通过确立的建模，译者断定，IL-12在与IL-1， ICAM-2或者Jagged-2主导肠道时，保守于作用于IL-17F，而与CD70， IL-23或者 LIGHT 主导显现时，则更保守于作用于IL-17A。另外，敲除IL-12，IL-17A和IL-17F的传达程度都相比较降低。这些结果陈述，IL-12参与Th17的作用于分化。为了进一步深入探讨IL-12作用于Th17的前提，译者换用体外作用于Th的建模，断定，IL-12极为能直接作用于Th17，但是，同时加入IL-1和IL-12，Th17就作用于出来了。这是一篇试验与学说独创的经典之作。试验结果与计算建模相互支持，相互教导，相辅相成。如下所示所示，试验以外换用了密切关联两以外样本，一是何种兴奋下DC肝细胞的叛离，二是叛离后的DC对T肝细胞的起着。学说以外以DC和T肝细胞的可用肝蛋白酶为一个中心，确立了肝蛋白酶之时有的朝著和但球队向作用于的网络建模。通过这一建模，译者预测出一些最初肝细胞时有相互人关系，最终再用试验存疑这些人关系是否存疑。这篇短文的令人难忘有两处，一是确立和试验学说独创分析的时是，二是短文中之外的诸多肝细胞作用于信息以供分析参考。完整记事：Grandclaudon M1, Perrot-Dockès M2, Trichot C1, et al.A Quantitative Multivariate Model of Human Dendritic Cell-T Helper Cell Communication.Cell. 2019 Oct 3;179(2):432-447.e21. doi: 10.1016/j.cell.2019.09.012.